Los proyectos realizados por profesores y alumnos del posgrado en Ciencias y Tecnología Farmacéuticas han tenido vinculación formal e informal con sectores público y privado, en las áreas de salud, industria farmacéutica y ecofarmacovigilancia.
El posgrado en Ciencias y Tecnología Farmacéuticas se ha fortalecido por diversos proyectos de triple hélice. Estos proyectos han recibido financiamiento por parte de la industria y los gobiernos federal o estatal, o bien de la UAEM. Además, se participa en proyectos de investigación con financiamiento federal para infraestructura y proyectos directos con la industria.
El laboratorio de Farmacia de la Facultad de Química colabora con el sector farmacéutico e industrias satelitales de manera cotidiana, y los alumnos y profesores del posgrado se involucran en estas actividades. Algunas colaboraciones son cortas, como la realización de análisis, la impartición de conferencias bajo solicitud expresa o las asesorías puntuales; otras son de mayor duración, como el apoyo para la elaboración de tesis de licenciatura o la capacitación y guía de alumnos de servicio social y estancias profesionales.
Los laboratorios en los que se desarrollan actividades de docencia e investigación también realizan proyectos cortos y otros en la modalidad de vinculación y cooperación formal, que en ocasiones implican la obtención de una fuente financiadora, y la firma de convenios específicos.